SQ6型双层运输汽车专用车的端门在SQ5型小汽车运输车的基础上进行了优化设计，解决了以往端门折页强度不足、密封性差的问题。为了尽可能利用车辆上部限界的空间尺寸，采用了折线型车顶，端门采用嵌入式一体式6扇对折端门。

SQ6型双层小汽车运输车自2009年年初投入运用以来，满足了铁路运输轻型客车、SUV、MPV、皮卡车等较高汽车以及国产和进口的各种微型、小型汽车的市场需求，极大地提高了双层运输汽车专用车的装载范围，取得了可观的经济效益，也是目前我国铁路运输小汽车的主型车辆之一。