2024年6月15日起，新一批技术提升型动车组CR400AF-S投入服务。与原有列车相比，新款技术提升型动车组优化电气柜等车内设备布局，将空余出来的空间用来增加载客量和设置更多的大件行李存放处，由此CR400AF-S全列定员达到619人。

8节编列车的8号车厢维持”反鱼骨”形状布局的商务座，分别定员6人；8编列车的1号车厢则改为旧式开放式“蛋壳形”商务座，定员5人。